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序列比对 - 百度文库
序列比对 - 百度文库
序列比对是生物信息学的基本组成和重要基础。序列比对的基本思想是，基于生物学中序列决定结构，结构决定功能的普遍规律，将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串，检测序列之间的相似性，发现生物序列中的功能、结构和进化的信息。
序列对齐（sequence alignment）的目的是通过两个或多个核酸序列或蛋白质序列进行对齐，并将其中相似的结构区域突出显示。通过比较未知序列与已知序列（尤其是功能和结构已知的序列）之间的同源性，往往可以很容易地预测未知序列的功能。
• 序列比对的目的：– 从核酸以及氨基酸的层次去分析序列的相同点 和不同点，以推测他们的结构、功能以及进化 上的联系– 通过判断两个序列之间的相似性来判定两者是 否具有同源性• 相似性：直接的数量关系，如：序列之间相似部分 的百分比
生物信息学第二章序列比对第一节 引Section 1言Introduction一 、同源、相似与距离（一） 同源 两个序列享有一个共同的进化上的祖先，则这两 个序列是同源的。 对于两个序列，他们或者同源或者不同源，不能 说他们70%或80%同源。
